特点：

1、Imaris 专为生命科学研究设计界面。提供一个任何尺寸图像的3 维、多通道和时间序列（4 维）图像处理和显示。

2、在光学显微镜领域，特殊的装载程序可以打开各个著名厂家的共聚焦和宽视场3D 和4D 激光共聚焦显微镜和其他高端显微镜图像系统图像格式，自动识别各个采集图像软件获得的采集数据。另外，也提供了最先进的为Tiff系列文件的装载程序，用户可以定义通道序列、时间点序列和Z 平面序列配置。所有模块可以运行在Windows 2000 ,Windows XP , Windows Vista 和 Mac (32 and 64bit) 。

3、结合速度，精度和方便使用，Imaris 使用丰富的渲染模式选择，实时可视化体积图像和目标。基于强度和尺寸，自动或手动鉴别目标。通过等位面应用一个针对任何通道数据的强度阈值，产生一个数据模式，显示为一个刚性表面。等位面能结合任何其他的视觉效果，产生非凡的图像。

4、通过在原来体积图像上叠加目标，实现有效的分割。个别目标的交互操作。仅用少量几次的鼠标操作，就可以创建出最令人印象深刻的图像。 

5、整个的Surpass 场景功能能在框架目标中的3 个面上产生阴影投影。有：最大强度投影，混合投影，普通阴影，

阴影投影和最小强度投影5 种模式。对切片，切面，图像库，Surpass 正交面，Surpass 斜切面和Surpass 体积进行渲染。

6、表面剪刀功能；剪辑平面功能和体积描绘功能。地形学目标显示对象表面型貌。

7、标度功能使用户可以在 3D 图像后面显示标度网格，为图像提供其结构尺寸信息。

8、对于时间系列多维数据，用时间滑块，扩展了所有的 3D 功能至3D + 时间。

9、导航窗口能全景显示图像数据，并实时显示观察区域。

10、动画功能户能够轻而易举地创建***（放大、缩小、移动、任意角度、飞入和飞出和随时间变化的动态）。

11、能打开和渲染巨大尺寸的图像。图像数据尺寸可以是超过计算机物理内存的。

二、Imaris MeasurementPro （Imaris 测量模块）

Imaris MeasurementPro 是在Imaris 进行特别的体积渲染，表面渲染和目标检测功能上，加入了几何学和强度测量功能。

有 3 个部分：

• Imaris 的功能延伸，对体元和次生目标统计测量数据进行自动计算和显示。

• 也可手动进行距离测量。

• 通过2D 图像上手动描绘轮廓方法，建立3D 表面。并进行自动测量形态学参数。

特点：

1、定量可视化信息：建立在Imaris 体积渲染，表面渲染和目标切面功能上的几何学和强度测量。比如，自动测量

3 维成像后的一块组织中各种细胞的相对绝对分布量，单个细胞或总体细胞的体积，表面积，荧光强度，光密度（见

如下所列参数）等各种形态学参数。

2、测量 3D 距离：让你在Imaris 生成的目标中定义点，然后迅速测出他们之间的距离。

3、强度检测：获得被选体元组强度的精确测量。

• 积分，标准差，中位数，最小值，最大值，质心

点

– 面积（总）

– 所有通道强度中心（平均）

– 所有通道强度平均（平均）

– 点数目（总）

– 体积（总）

– 体积

– 所有通道数据强度平均

– 所有通道数据强度标准差

– 所有通道数据强度总和目标表面

– 面积

– 椭圆度（, 扁度）

–        椭圆度（伸展度）

– 球面度

– 所有通道最小强度

– 所有通道最大强度

– 所有通道平均强度

– 所有通道中位强度

– 所有通道强度标准差

– 所有通道强度总和体积

三、Imaris Track （Imaris 三维运动寻迹模块）

追踪独立目标在三维空间随时间的变化和运动。目标可以是表面目标或者是点目标。两种类型的目标均可以用自动或手动方法创建。

特点：

1、自动构建轨迹：轨迹可以从等位面或点获得。 3D 预览帮助寻找适当的分割参数并自动创建轨迹。

2、编辑轨迹：轨迹编辑器让你方便地修正目标间的连接。连接可以是一对一，一对多（分散的），多对一（合并的），或多对多。

3、测量轨迹：重要的描绘性统计可以被测量和输出。如：

• 轨迹长度，目标速度，分支点数目可以被获得每个目标随时间变化的轨迹统计数据。

4、可视化轨迹：轨迹可以用线条或圆柱体显示。它们可以用时间颜色映射图上色。轨迹可以与任何在Surpass 中获得的目标合在一起，从而产生给人印象深刻的3D 和4D 可视化图像。

5、轨迹算法：

• 布朗运动，自回归运动，自回归运动差异缩小

6、轨迹显示：龙尾方式显示目标对象在过去的N 帧移动过程中的位置（N 可被设置）。并可显示轨迹中的位移。

7、具有筛选功能，即：可以显示群体中某种运动速度的目标。

四、ImarisColoc （Imaris 共定位模块）

ImarisColoc 被设计给用户提供一个多功能，高技术的工具，和其他Imaris 功能无缝沟通。用来定量和记载多染色生物成分的共分布。

特点：

1、ImarisColoc 针对3D 和4D 图像工作，每一步的操作都是速度优化的，给予用户一个即时的结果。

2、自动，标准化决定共定位体元。 自动阈值设定。

3、在直方图或图像上手动选择阈值。

4、完全整合 Imaris 其他模块。处理 2D，3D，和4D 图像。

5、结合 Surpass 高级可视化，显示新的共定位通道（空间显示共定位）.

五、FilamentTracer （检测，寻踪和分析丝状体模块）

FilamentTracer 是显微镜图像下自动检测神经元的主导软件产品。同时也可用来进行非神经元丝状体的检测。它可以帮助用户与任何神经元细节进行互动，追随神经元分支式样,改变神经元的形貌并获得特殊的定量信息。并具有重复性。  

特点：

1、选择优化的追踪策略：

FilamentTracer 采用了一个自动分析和运算判断优化组合策略，让用户从手动到自动范围选择4 个互相补充追踪策略。

1）自动追踪：Filament 属性对话框通过创建过程指导用户。在这个过程各个阶段中，全部和surpass 的观察互动

保持有效：

• 通道选择，可选特征过滤。

• 分割，连续基线过滤。

• 图形编辑，自动转换分割图像至图表，并去除用户定义的最小长度下的侧分支。

• 每一步的结果可以被可视化评估，被接受（下一步）或丢弃（后退）。

2）自动路径（半自动跟踪）：快速行变程计算，在手动选择一个起始点和目前光标点位置之间寻找最短的路径。

3）自动深度追踪。

4）手工描绘：用户可以在图像模版上手动追踪细丝。

2、卓越的导航和视觉化效果：

FilamentTracer 利用最可能的方法，超快速度显示3D 场景和隐藏的特殊信息来揭示观察区域。

3、用户自定义的针对模拟软件的报告和界面：

FilamentTracer 让你可以直接从神经元图像的视图上进行手动测量。除了提供统计输出模式，FilamentTracer程序界面还允许用户接近个别的分段和分支点。用户程序可以直接和正在运行的Imaris 交互，从而将特殊分析工具和Imaris 紧密整合在一起。用Imaris 自身对神经元和基因的输出数据，并采用程序界面，允许其他的输出格式。

统计值

• 树突

– 长度

– 直径

– 分支水平

– 分支角度

– 树突棘密度

– Scholl

– 其他

• 树突棘

– 长度

– 体积

– 头部直径

– 颈部直径

– 分支水平

–        其他

六、ImarisInPress（Imaris 排版模块）

针对你要报告和发表文章，你可以为你的 Imaris 图片加上标题，说明，标签和其他强调点。

1、ImarisInPress 让你可以直接将图片输出到word 和报告文件。

2、ImarisInPress 让你以图像数据的方式储存你的图片，这样，你就可以在需要的时候容易地修改它们。例如：改变背景颜色或轻微修改3D 场景的观察角度。

七、ImarisXT （Imaris 扩展模块）

ImarisXT 是一个从Imaris 到经典程序语言和领先的科学程序语言Matlab 的双向接口。通过 ImarisXT， 你可以轻易地将你自己对图像处理、分割、分类和报告的算法整合入Imaris。或者，你也可以在你自己的主应用中将你运行的Imaris 转入一个专门的可视化和互动引擎。

八、AutoAligner（自动对准软件）

自动对准连续切片的软件。可以用在光镜切片和电镜切片上。

AutoAligner 读取连续切片的堆栈，并自动将单个的图像进行对准。全自动对每张图像通过平移或旋转，将原来按照顺序的图像对准排列。创建后的3D 空间，可以用Imaris 进行观察。

AutoAligner 也提供了手动的方法，这是针对一些相差很大，不能被自动对准的相邻图像而言。可视化的对准工具利用快速显示技术，全自动实时对准图像。

九、AutoDeblur （自动解模糊，自动反卷积软件）

AutoDeblur，在保留数据完整性同时，提供了优异的精确度和准确度。它可用于现时所有光学显微镜图像，包括宽视场荧光，共聚焦（ CLSM 和SDC ），透射光明场，多光子和微分干涉相差。用AutoDeblur 进行反卷积，逆转PSF效应，回复图像的质量和准确度，增加图像的分辨率，反差和信噪比.

特点：

1、AutoDeblur 的核心算法是目前市场上最先进，最高性能的。具有：球差检测和校正专利。

2、AutoDeblur 提供：

• 过滤和恢复算法

• 支持多种显微镜形式

• 基于模型的先进噪音抑制

• 球差检测和校正专利

• 真正的自适应2D 和3D 盲法反卷积。