带正电荷的罗丹明染料（例如罗丹明酯和rosamines）都可以选择性的定位于线粒体中，因此它们广泛地用于标记活细胞中的线粒体。这种特殊的罗丹明酯将线粒体着色，带橙色荧光；其光谱特征与TRITC相似，这使罗丹明B乙酯使用起来非常方便。