nrStar™ Human snoRNA PCR Array
在当前市场的同类产品中，nrStar™ Human snoRNA PCR Array包含了最新最全的snoRNA内容。此款芯片从权威数据库SnoPY 与 snoRNA-LBME-db精心挑选了359条snoRNA，覆盖了所有PCR技术可区分的snoRNA，是进行snoRNA表达检测与功能研究必不可少的工具。
产品列表
| 产品名称 | 规格 | 描述 |
| nrStar™ Human snoRNA PCR Array | 1 plate | 359条snoRNA、7条snoRNA靶向snRNA以及4条snoRNP复合物成员mRNA |
核仁小RNA (snoRNA) 是一类中等长度的非编码小RNA。其长度60-300 nt不等，是snoRNPs 复合物的主要成员之一 [1]。在脊椎动物中，核仁小RNA的编码基因主要位于蛋白编码基因的内含子区，其转录产物经转录后加工形成成熟的核仁小RNA [2]。snoRNA参与多种生物学过程，包括rRNA的加工处理，RNA剪接和翻译，以及对氧化应激反应的调控 [3]。在snoRNP复合物中，snoRNA通过碱基互补原理识别rRNA上的特定位点，引导复合物对这些位点进行2＇-O甲基化和假尿嘧***化修饰。根据snoRNA结构与功能的不同，可将snoRNA分为两大类：负责2＇-O甲基化的box C/D snoRNA和负责假尿嘧***化的box H/ACA snoRNA [1]。另外，还存在一类比较特殊的snoRNA— scaRNAs。scaRNAs特异表达于细胞核的Cajal小体，具有类似的C/ D box或H/ ACA box结构[4]。snoRNA还产生类似miRNA的小片段非编码RNA，可与AGO蛋白结合并识别靶向mRNA序列，从而调控翻译过程[5]。
多项研究表明，snoRNA在肿瘤中异常表达，并在肿瘤转移过程中扮演着重要角色。snoRNA可作为肿瘤促进剂或抑制剂发挥功能 [6-7]。例如，SNORD50A/B作为肿瘤抑制剂能够直接结合K-Ras并抑制其活性，它常在癌症中发生缺失突变 [8]；SNORD44 (RNU44) 和SNORD43 (RNU43) 则与乳腺癌的不良预后有关[9]；SNORA80E (SNORA42) 在肺癌中作为癌基因存在，抑制SNORA42的表达能够产生明显的抗癌作用 [10]。令人惊讶的是，C/D Box snoRNAs在癌症中普遍高表达 [11]。另外，snoRNA在神经退行性疾病的发生发展过程也发挥着关键作用。snoRNAs在血液、痰液以及尿液中稳定存在，是高潜能的疾病诊断分子标志物。目前snoRNAs已成为疾病领域特别是癌症领域的研究热点。
nrStar™ Human snoRNA PCR芯片包含359条snoRNA，7条snoRNA靶向snRNA和 4条snoRNPs复合物成员mRNA。此芯片覆盖了所有PCR技术可区分的snoRNA，能够快速方便的对组织、细胞或血液中的snoRNA进行表达检测。高覆盖度、灵敏度以及准确率使其成为疾病分子标志物高通量筛选与验证的最佳选择。
芯片还包含3个snoRNA参照基因与2个mRNA参照基因，可以更好的对qPCR结果进行定量和均一化处理。芯片还使用GDC对照组来监测潜在的基因组DNA污染。
芯片特点
● 最佳覆盖范围—同一块384孔板上覆盖了所有PCR技术可区分的snoRNA，snoRNA 靶基因以及snoRNP复合物成员
● 无与伦比的灵敏度—只需50 ng总RNA，无需扩增
● 稳定有效的PCR引物—所有引物均在不同的细胞组织样本通过严格验证
● 简单快速—无需扩增，只需将反转好的cDNA与SYBR® Green master mix混合加入到板中，然后运行qPCR, 4小时内即能得到实验结果
● 疾病分子标志物筛选—高覆盖度、灵敏度、准确率以及高通量使其成为疾病分子标志物筛选与验证的首选
工作流程
图一. nrStar™ Human snoRNA PCR Array工作流程
适用的定量PCR仪：
ABI ViiA™ 7，ABI 7500 & ABI 7500 FAST，ABI 7900HT，ABI QuantStudio™ 6 Flex，Real-Time PCR system，ABI QuantStudio™ 7 Flex Real-Time PCR system，ABI QuantStudio™ 12K Flex Real-Time PCR System，Bio-Rad CFX384，Bio-Rad iCycler & iQ Real-Time PCR Systems，Eppendorf Realplex，QIAGEN Rotor Gene Q100，Roche LightCycler480，Stratagene Mx3000，Roche LightCycler480
数据库
SnoPY：http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/
snoRNA-LBME-db：https://www-snorna.biotoul.fr//
| C/D BOX(213)
SNORD4A; SNORD5; SNORD6; SNORD7; SNORD8; SNORD9; SNORD10; SNORD119; SNORD121A; SNORD121B; SNORD123; SNORD124; SNORD126; SNORD127; SNORD1A; SNORD1B; SNORD1C; SNORD2; SNORD101; SNORD102; SNORD103; SNORD103B; SNORD104; SNORD105; SNORD105B; SNORD12C; SNORD13; SNORD14A; SNORD14B; SNORD15A; SNORD15B; SNORD16; SNORD18A; SNORD18B; SNORD18C; SNORD20; SNORD21; SNORD22; SNORD24; SNORD25; SNORD26; SNORD27; SNORD28; SNORD3; SNORD30; SNORD31; SNORD32A; SNORD32B; SNORD33; SNORD34; SNORD35A; SNORD35B; SNORD36A; SNORD36B; SNORD36C; SNORD37; SNORD38A; SNORD38B; SNORD41; SNORD42A; SNORD42B; SNORD43; SNORD4B; U97; SNORD96B; SNORD96A; SNORD95; SNORD94; SNORD86; SNORD84; SNORD83B; SNORD83A; SNORD117; SNORD82; SNORD81; SNORD80; SNORD118; SNORD78; SNORD77; SNORD76; SNORD75; SNORD73a; SNORD63; SNORD62B; SNORD61; SNORD60; SNORD59B; SNORD59A; SNORD58B; SNORD58C; SNORD57; SNORD56; SNORD55; SNORD54; SNORD53; SNORD52; SNORD51; SNORD50; SORD50B; SNORD48; SNORD47; SNORD46; SNORD45A; SNORD45B; SNORD45C; SNORD44; SNORD12; SNORD12B; SNORD112; SNORD113-1; SNORD114-1; SNORD17; SNORD19; SNORD19B; SNORD23; SNORD65; SNORD66; SNORD67; SNORD88A/B/C; SNORD68; SNORD69; SNORD70; SNORD71; SNORD72; SNORD85; SNORD87; SNORD90; SNORD91A; SNORD91B; SNORD92; SNORD93; SNORD98; SNORD99; SNORD100; SNORD109A/B; SNORD115-1; SNORD110; SNORD111; SNORD111B; SNORD116-1; SNORD11; SNORD11B; SNORD12; SNORD12B; SNORD113-2; SNORD113-4；SNORD113-5; SNORD113-6; SNORD113-7; SNORD113-8; SNORD113-9/ SNORD113-3; SNORD114-10/18; SNORD114-11; SNORD114-12/14; SNORD114-13; SNORD114-15/3/5/21/23/25/26; SNORD114-17/4; SNORD114-19; SNORD114-2; SNORD114-20/21/22/28; SNORD114-24; SNORD114-29/30; SNORD114-31; SNORD114-6/9; SNORD114-7; SNORD115-11; SNORD115-12; SNORD115-17/18/23; SNORD115-27/29/30; SNORD115-28; SNORD115-36; SNORD115-37; SNORD115-48; SNORD116-11; SNORD116-12/16/17/18/21/22/24; SNORD116-13/14/15/20; SNORD116-19; SNORD116-23; SNORD116-25/26; SNORD116-27/29/30; SNORD116-28; SNORD116-5; SNORD116-6; SNORD116-9; SNORD79; SNORD58A; SNORD49A; SNORD49B; SNORD45BL2; SNORD42BL1; SNORD3@L39; SNORD3@L19; SNORD118L14; SNORD3L3; SNORD118L11; SNORD68L1; SNORD118L9; SNORD3@L37; SNORD74L5; SNORD45BL1; SNORD65L2; SNORD23; SNORD38BL3; SNORD44L1; SNORD74L4; SNORD45BL3; SNORD56L7; SNORD77L3; SNORD41L1; SNORA25L14; SNORD75L2; SNORD114-15L1; U3.41-201; SNORD53L1; SNORD55L1; SNORD62BL1; SNORD51L1 |
| H/ACA BOX(122)
SNORA10; SNORA13; SNORA14A; SNORA14B; SNORA15; SNORA16; SNORA17; SNORA18; SNORA19; SNORA21; SNORA22; SNORA23; SNORA24; SNORA25; SNORA28; SNORA3; SNORA2B; SNORA45; SNORA30; SNORA31; SNORA33; SNORA34; SNORA36; SNORA36B; SNORA37; SNORA38; SNORA39; SNORA4; SNORA41; SNORA42; SNORA43; SNORA44; SNORA46; SNORA48; SNORA49; SNORA5A; SNORA50; SNORA51; SNORA52; SNORA53; SNORA54; SNORA55; SNORA56; SNORA58; SNORA59; SNORA5B; SNORA5C; SNORA6; SNORA60; SNORA61; SNORA77; SNORA80; SNORA80B; SNORA7A; SNORA8; SNORA9; SNORA62; SNORA63; SNORA47; SNORA35; SNORA26; SNORA11B; SNORA11D; SNORA11E; SNORA36C; SNORA38B; SNORA84; SNORA11; SNORA12; SNORA73A; SNORA73B; SNORA74A; SNORA74B; SNORA64; SNORA65; SNORA66; SNORA67; SNORA70; SNORA70B; SNORA70C; SNORA70D; SNORA70E; SNORA70F; SNORA71A; SNORA71B; SNORA72; SNORA99; SNORA71D; SNORA20; SNORA27; SNORA29; SNORA32; SNORA40; SNORA78; HBI-61; SNORA11C; SNORA68; SNORA69; SNORA16B; SNORA1; SNORA72L7; SNORA64L2; SNORA18L1; SNORA62L2; AL137790.4; SNORA11DL1; SNORA51L11; SNORA10L1; SNORA12L2; SNORA11EL1; SNORA70BL6; SNORA20L1; SNORA63L9; SNORA18L2; SNORA20L4; SNORA11BL2; SNORA67L1; SNORA32L2; SNORA2AL1; SNORA43L2; SNORA12L1; SNORA62L4 |
| Cajal body-specific scaRNAs(24)
SCARNA18; HTR; HBII-382; SCARNA13; SCARNA8; SCARNA17; SCARNA7; SCARNA12; SCARNA6; SCARNA5; SCARNA10; SCARNA14; mgU2-25/61; SCARNA9; mgU12-22/U4-8; HBI-100; ACA68; ACA66; SCARNA11; SCARNA16; SCARNA1; SCARNA4; SCARNA23; SCARNA22 |
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