特点描述：
空间节约型设计
Thermo Scientific PlateMate 2X3 的整体设计十分紧凑，既可方便地放置于各种实验台面作为具有用户安全保护功能的独立工作站使用，也可作为液体处理组件整合入较大的自动化系统。
全能型六板位操作台
由于具有多种即插即用型配件，PlateMate 2X3 是进行板间转移，板式重排及连续稀释操作的理想选择，可实现包括真空提取或过滤、96孔同时穿刺、IC50或EC50测定、温度控制及条码阅读等多种功能。标配的操作台上另有一个24 V直流电源插座，可为台上其它外周设备供电。
可更换八种移液头
采用空气置换或正向置换式技术的八种可更换96道或384道移液头，具备50 nl (PocketTips) - 300 μl 的分液体积。这种灵活性使得Platemate 2X3适用于24，48，96，384和1536孔板等多种移液应用。专用的可抛弃型吸头(Disposable Automation Research Tips, D.A.R.T.s)拥有滤芯型、加长型及宽口型等多种选择，提高了移液灵活性。
快速移液
- 板间转移(10 μl) ：28 sec
- 96孔板至384孔板(10 μl) ：1 min 13 sec
- 按列梯度稀释(10 μl)，96孔板整板(3次混合)：4 min 30 sec
- 人工更换D.A.R.T.s吸头：24 sec
- 机械臂自动更换D.A.R.T.s吸头：54 sec
ControlMate 软件
免费的ControlMate软件具有直观的用户界面，使得程序的编写和修改快捷、简便。对于需要Active X 控件进行自动化集成的应用，有ControlMate OLE可供选择使用。软件可以在多台计算机上安装，可实现远程程序创建、编辑及验证。
技术规格：
宽度：635mm
长度：749mm
康成生物LncRNA芯片技术服务实验流程
1. 样品总RNA抽提
若实验对象为组织样品，取适量（50-100mg）新鲜组织样品或正确保存的组织样品，加1ml的RNA抽提试剂Trizol（Invitrogen），匀浆后抽提RNA。
若实验对象为细胞样品，每份样品取1×106~1×107细胞，完全吸去培养液后加1ml的RNA抽提试剂Trizol（Invitrogen），裂解后抽提RNA。
2. RNA质量检测
使用Nanodrop测定RNA在分光光度计260nm、280nm和230nm的吸收值，以计算浓度并评估纯度。
使用甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测RNA纯度及完整性
3. cDNA样品合成和标记
4. 标记效率质量检测
使用Nanodrop检测荧光标记效率，以保证后续芯片实验结果的可靠性。
5. 芯片杂交
在标准条件下将标记好的探针和高密度芯片进行杂交。
6. 图像采集和数据分析
使用GenePix 4000B芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度，并将实验结果转换成数字型数据保存，使用配套软件对原始数据进行分析运算。
7. 提供实验报告
芯片扫描图
实验方法中英文报告
RNA质检报告
芯片数据结果报告，包括差异表达LncRNA列表，差异表达基因列表
常规lncRNA芯片研究流程
康成客户实例——Arraystar LncRNA表达谱芯片
Repression of the long noncoding RNA-LET by histone deacetylase 3 contributes to hypoxia-mediated metastasis. Molecular Cell. 2013.
使用芯片： Arraystar Human LncRNA Microarray
研究者通过 Arraystar Human LncRNA芯片筛查到了在肝细胞癌中特异性低表达的LncRNA分子（LncRNA-LET），并在大规模临床样本中利用实时定量PCR实验发现该LncRNA分子在肝细胞癌、结肠癌和鳞状细胞肺癌中都有特异性低表达；进一步的研究表明该LncRNA的显著下调由缺氧性组蛋白脱乙酰化酶3介导，并通过调节NF90蛋白影响癌细胞转移。本研究首次在分子机制的角度阐述了缺氧、组蛋白乙酰化、LncRNA分子和癌细胞转移之间的关系，找到了新的影响癌细胞转移的治疗靶点，有着重大的生物和临床意义。
HBx-related lncRNA Dreh inhibits hepatocellular carcinoma metastasis by targeting the intermediate filament protein vimentin. Hepatology. 2012.
使用芯片：Arraystar Mouse LncRNA Microarray
研究人员利用Arraystar Mouse LncRNA芯片在HBx转基因小鼠肝脏中筛选出差异表达的LncRNA，其中LncRNA.Dreh (AK050349)表达量在所有年龄和性别的转基因小鼠中都显著下调。对LncRNA.Dreh进行深入研究发现，LncRNA.Dreh能结合中间丝蛋白并抑制其表达，通过改变细胞骨架结构和形态，抑制癌细胞的增殖和转移。对50例临床样本(肝癌组织v.s.癌旁组织)的研究发现：该分子在癌组织中表达量比正常组织低，并且和病人的预后相关，LncRNA.Dreh表达量高的病人复发率低并且生存期长。该研究首次将乙肝病毒自身表达的HBx蛋白和肝脏组织中的LncRNA关联起来，找到了新的肝癌预后标志物，有着重大的临床意义。
Long non-coding RNA high expressed in hepatocellular carcinoma (LncRNA-HEIH) facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2. Hepatology. 2011
使用芯片： Arraystar Human LncRNA Microarray
研究者首先通过LncRNA芯片实验和RT-PCR验证，在5例肝癌组织与5例癌旁组织样本中找到了一个肝癌细胞高表达的LncRNA（LncRNA-HEIH），并且在大量样本（50例肝癌和正常组织，20例肝硬化组织和正常肝组织）验证了LncRNA-HEIH的特异性。通过基因共表达网络图和病人生存时间等临床数据关联分析，发现LncRNA-HEIH可以作为一个独立的判断HCC病人生存时间的预后指标。一般LncRNA-HEIH表达越高，HCC病人的预后越差。然后研究人员对LncRNA-HEIH的功能展开了深入的研究。首先利用过表达技术（gain of function ）和RNAi技术（loss of fuction）发现LncRNA-HEIH能促进细胞增殖，在细胞周期调控过程中起重要作用。RNA免疫共沉淀和ChIP等实验揭示了LncRNA-HEIH可以通过结合EZH2招募PRC2，进而抑制下游靶基因的表达，实现调控细胞周期的功能。这些结果提示在肝细胞癌症发生过程中，LncRNA-HEIH可能是一个重要的调控“枢纽”。
上图：肝癌（n=5）和癌旁组织（n=5）的芯片聚类结果。Arraystar公司的lncRNA芯片同时设计了mRNA与lncRNA，图A为差异表达的254个mRNA聚类结果，图B为差异表达的174个lncRNA聚类结果。红色代表上调，绿色代表下调。
二、LncPathTM 芯片技术服务
长链非编码RNA (LncRNA) 是一类转录本长度超过200nt的RNA，它们本身并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。近年来的研究表明：LncRNA广泛参与各种信号通路，LncRNA的异常表达与包括癌症在内的多种疾病密切相关。迄今为止，研究得比较透彻的LncRNA还很少，超过99%的LncRNA的功能和调控机制尚不清楚。为了促进LncRNA的研究，Arraystar公司开发了LncPathTM 疾病/信号通路特异性LncRNA芯片。LncPathTM 芯片可以同时检测与特定疾病或信号通路相关的LncRNA以及相应的靶基因，帮助客户快速的将LncRNA的调控机制与其在特定的信号通路或疾病中的生物学功能联系起来。
| 康成生物是Arraystar公司中国地区唯一代理商，为您提供一站式LncPathTM 芯片技术服务，您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并提供完整的实验报告。 |
LncPathTM 疾病/信号通路特异性LncRNA芯片产品列表
• 对疾病/信号通路特异性LncRNA可靠的收集
• 快速的建立LncRNA调控机制与其生物学功能之间的联系
• 图形化的展示LncRNA及其靶基因的信息
• 创新性的探针设计
• 高效、稳定的标记系统
• 可靠的芯片性能
• 聚焦于与疾病或信号通路相关的少量LncRNA和mRNA，使得数据分析流程更加快速，精准。
对疾病/信号通路特异性LncRNA可靠的收集
LncPathTM芯片通过整合权威数据库，经典文献和Arraystar LncRNA数据库等资源，对疾病/信号通路特异性的LncRNA进行了全面，可靠的收集，涵盖的LncRNA主要有：1）疾病/信号通路特异性蛋白编码基因的邻近LncRNAs； 2） 疾病/信号通路特异性蛋白编码基因的长链非编码ceRNAs； 3） 已知的与特定疾病或信号通路相关的LncRNAs。
图1. LncPathTM芯片的LncRNA收集流程。
快速的建立LncRNA调控机制与其生物学功能之间的联系
LncPathTM芯片可以同时检测与特定疾病或信号通路相关的LncRNA以及相应的靶基因，并且对LncRNA和靶基因的关系进行了详细的注释，能够帮助客户快速的将LncRNA的调控机制与其在特定的信号通路或疾病中的生物学功能联系起来。
图2. 通过LncPathTM芯片建立LncRNA的调控机制与其生物学功能之间的联系。
图形化的展示LncRNA及其靶基因的信息
LncPathTM芯片提供LncRNA及其靶基因信息的图形化展示，通过图形化展示客户可以迅速了解LncRNA及其靶基因的关系（图3），方便后续的机制和功能研究，这些图形化展示结果都可以通过Arraystar网站免费获得。
图3. 可能调控WNT信号通路中的关键基因CCND2的LncRNAs详细信息。
创新性的探针设计
LncPathTM芯片采用了创新性的探针设计：针对每个LncRNA设计转录本特异的LncRNA探针，保证对LncRNA的准确检测。针对每个蛋白编码基因设计两种探针：基因探针和转录本特异性探针。基因探针用于检测基因水平的表达情况，它的信号可以用来表征邻近LncRNA或其它LncRNA通过转录调控机制对此蛋白编码基因的影响。转录本特异性探针用于检测此基因的经典转录本的表达，它的信号可以用来表征长链非编码ceRNA或其它LncRNA通过转录后调控机制对此蛋白编码基因的影响（图4）。
图4. LncRNA探针：转录本特异性探针，可以准确的检测LncRNA；
基因探针：用于检测蛋白编码基因在基因水平的表达情况。它的信号可以用来表征邻近LncRNA或其它LncRNA通过转录调控机制对此蛋白编码基因的影响。
转录本特异性探针：用于检测蛋白编码基因在转录本水平的表达情况。它的信号可以用来表征长链非编码ceRNA或其它LncRNA通过转录后调控机制对此蛋白编码基因的影响。
高效、稳定的标记系统
LncPathTM芯片采用了一种高效，灵活的标记系统（图5）。这种标记方法不但可以同时标记带PolyA尾巴和不带PolyA尾巴的转录本，还可以极大的增加低丰度RNA和降解RNA的cRNA产率，灵敏度比常规标记方法高100倍以上。
图5. 高效，灵活的标记系统。
可靠的芯片性能
高灵敏度：能准确检测跨域5个数量级的低丰度RNA （图6）
图6. LncPathTM芯片具有跨越超过5个数量级的检测范围。横轴代表Spike-in浓度的log值，纵轴表示Spike-in芯片信号（log2转化后）。
高重复性：Arraystar circRNA 芯片实验的技术重复组之间具有很好的相关性（R2>0.9）（图7）
图7. LncPathTM芯片技术重复间的散点图。分别用同样的样品在不同两天进行芯片标记和杂交反应，并根据芯片信号做出散点图，从图中可以看出：芯片间的相关性非常高（R2>0.9），说明LncPathTM芯片平台重复性很好，非常稳定。
LncPathTM疾病/信号通路特异性LncRNA芯片应用思路
康成生物疾病/信号通路特异性LncRNA芯片技术服务流程
上海康成生物工程有限公司
地址：上海市漕河泾高新技术开发区虹漕路421号63号楼2楼
免费热线：400-886-5058 ; 800-820-5058（座机）
电话：021-64451989 传真：021-64452021
网址：www.kangchen.com.cn