Hieff NGSTM RNA Cleaner

随着转录组学的不断深入,RNA的类型,表达调控以及功能的复杂程度远远超乎我们的想象。去除含量占80%以上的核糖体RNA有助于将测序集中在含量少但信息大的RNA上。目前去除rRNA主要是通过探针和RNase H联合使用的方式,处理后的RNA会混杂很多消化产物,酶和离子,不利于后续RNA文库的构建。为此翊圣生物独立研发了RNA纯化试剂盒——Hieff NGSTM RNA Cleaner。该产品是基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization)原理,不需要增加沉淀步骤,就可以高效去除蛋白、盐离子和其它杂质,获得高纯度浓缩的RNA样本。
除此之外,翊圣生物凭借其严格的生产工艺和质量控制,充分保证了产品的性能和批次间的稳定性。
产品适用于纯化去除rRNA后的总RNA样本,体外转录的RNA产物,RNA标记产物以及合成的RNA等。纯化后的RNA适用于RNA文库构建、RT-PCR、qRT-PCR、芯片分析、Northern Blot和RNAi等实验。
整个纯化过程无需离心、抽滤和沉淀,只需要简单的6步就可以获得高纯度的RNA样品。

图1 RNA纯化流程
①将稀释后的RNA样品与磁珠混合;
②通过磁力器进行分离,并吸除上清;
③80%乙醇漂洗一次;
④再次用80%乙醇漂洗一次;
⑤用无RNase的水进行洗脱;
⑥磁力器分离,并转移上清。
Hieff NGSTM RNA Cleaner 适用于不同来源的RNA样本,与同类产品相比具有更加出色的回收效率。Agilent 2100 Bioanalyzer分析结果显示,使用Hieff NGSTM RNA Cleaner获得的峰值均比同类公司高,而峰值的大小代表了相应分子量RNA的含量。
1)细胞样本总RNA纯化 图1.人HepG2-总RNA样品在使用纯化试剂盒纯化前后的RNA电泳结果。 L:Ladder;N:竞品公司;Y:Yeasen公司;检测仪器:Agilent 2100 Bioanalyzer  |
2)拟南芥样本总RNA纯化 图2.拟南芥-总RNA样品在使用纯化试剂盒纯化前后的RNA电泳结果。 L:Ladder;N:竞品公司;Y:Yeasen公司;检测仪器:Agilent 2100 Bioanalyze  |
3)水稻样本总RNA纯化  图3.水稻总RNA样品在使用纯化试剂盒纯化前后的RNA电泳结果。 L:Ladder;N:竞品公司;Y:Yeasen公司;检测仪器:Agilent 2100 Bioanalyzer |
使用Hieff NGSTM RNA Cleaner,可以有效去除影响RT-PCR反应的抑制剂,让检测结果更加真实。如下表所示,使用相同质量的RNA样品,进行纯化前后Gapdh和β-actin的荧光定量分析,得到的Ct值纯化后比纯化前小。表明纯化后PCR可以得到更高效的扩增。
RNA样品 | 人 | 小鼠 | 拟南芥 |
检测基因 | Gapdh | β-actin | Gapdh | β-actin | PP2A | TUB2 |
纯化前Ct值 | 12.92 | 12.36 | 18.74 | 18.53 | 24.33 | 22.2 |
纯化后Ct值 | 12.32 | 11.89 | 17.62 | 17.91 | 23.38 | 21.35 |
表1:使用总RNA纯化试剂盒纯化前后,RNA样品qRT-PCR Ct值变化
品牌 | 货号 | 名称 | 规格 | 价格(元) |
Beckman | A63987 | Agencourt RNA Clean XP- cDNA和cRNA体系纯化试剂盒 | 40 mL | 7500.00 |
Yeasen | 12602E56 | Hieff NGSTM RNA Cleaner | 60 mL | 4266.00 |
常见问答:
1. RNA回收效率低或者没有。
1)RNA发生降解。操作过程要严格的确保无RNase的污染。
2)样本质量低。对于需要纯化的总RNA样本,建议Agilent 2100 Bioanalyzer分析后RIN值在7.0以上。
3)洗脱效率低。80%乙醇需现用现配,放置时间过久,可能由于乙醇挥发,造成浓度降低,影响洗脱效果;
4)洗脱溶液孵育时间过短。磁珠应于洗脱液中按规定时间孵育,常规为5 min;
5)磁珠过度干燥。切勿室温干燥磁珠大于10 min,过度干燥将降低洗脱效率。
2.纯化RNA中有磁珠残留。
1)磁珠分离时间过短或磁力器磁力较弱。增加分离时间或选用磁力强的磁力器,确保磁珠被磁力器全部吸附;
2)洗脱步骤中,吸取上清速度过快。缓慢吸取上清,注意切勿吸取磁珠。
3.如何检测回收后RNA的纯度?
可以通过测定A260/A280的比值来评估。
4.为什么分离后得到的RNA,OD 260/280比较低呢?
A260/A280的比值容易受到PH的影响,一般来说PH越低,A260/A280的比值就越低。建议使用10 mM Tris·Cl,PH 7.5进行溶解,再测定。
产品订购:
产品 | 货号 | 规格 | 价格(元) |
Hieff NGSTM RNA Cleaner | 12602ES01 | 1 mL | 366.00 |
Hieff NGSTM RNA Cleaner | 12602ES08 | 5 mL | 1066.00 |
Hieff NGSTM RNA Cleaner | 12602ES56 | 60 mL | 4266.00 |
Hieff NGSTM RNA Cleaner | 12602ES75 | 450 mL | 38566.00 |
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