便携式植物表型平台KeyBox
型号:: KeyBox
价格:请致电:010-57128832,18610462672
品牌: 荷兰    产品商标: keygene

 便携式植物表型平台 KeyBox

国际上最小的便携式植物表型平台
 
1 背景
欧盟最大的农业生物科技公司——荷兰KeyGene公司,是一家专注于提供基因型-表型分析和性状及关联基因挖掘服务的公司。自从2011年由KeyGene公司和德国LemnaTec共同建立的欧洲植物表型平台PhenoFab投入运转后,迅速积累了大量的基因型-表型测量和分析经验,并取得了异常出色的结果,从而导致PhenoFab一直处于满负荷运转状态。
基于大量的PhenoFab使用经验和数据分析的基础,KeyGene研发出了一款国际上最小的便携式植物表型平台KeyBox。
KeyBox的是为了解决PhenoFab工作人员在实际应用中遇到的问题而面世的,并且从设计最初就要求能够操作简单、不需进行复杂的软件学习,即使是育种公司的一般工作人员也容易掌握。
KeyBox已经被大量实验证明是非常高效、有价值的。正如世界闻名的集科研育种、种子生产及开发销售为一体的专业化蔬菜育种公司——荷兰安莎种子集团公司(ENZA ZADEN)的育种家Martijn van Stee所说“我们用KeyBox在世界各地进行了高通量的表型分析,它在将表型量化方面被证明非常可靠”。
2 快速打包设计
考虑到KeyBox可能需要经常带到温室、野外或其它地方进行测量,因此它被设计成可快速拆卸、打包的样式。将KeyBox打包后,就成为一个拉杆箱,方便运输和携带。
3主要功能
 对植物体进行整株或器官(果实、种子、根系、叶片、幼苗等)的表型成像
 便携可折叠式设计,方便带到温室或野外使用
 标准光照环境,数据可重复
 经验丰富的专家根据应用经验设计的软件,操作简单,解决农业应用中遇到的问题
 内置颜色校正和读取电子标签的程序
 可选一系列的功能程序模块,并不断升级中
4应用领域
 表型性状分析/挖掘,基因型-表型关联
 农业育种
 园艺学、农业信息学
 果实品质分析
 植物病理研究
 生物量分析
 种子萌发研究
 抗逆研究
 
5KeyBox的工作软件Pheno-suite由KeyGene公司强大的生物信息学和软件团队开发,充分考虑在实际应用的需求,操作简单,功能强大。
 
Pheno-suite的工作模块包括:
 基础整合模块。内置在软件中,是软件的基本组成部分。
 选配模块。功能强大,针对应用的每个算法是一个模块,客户可以根据需求选配。
 
基础整合模块
 颜色校准 Color correction
 标签识别 Label recognition
 灰度图转换 Gray scale conversion
功能强大的选配模块
 生物量测量 Biomass detection
 形态大小测量 Tomato size
 种子萌发测量 Seed germination in tray
 叶片大小测量 Leaf size detection
KeyGene在不断的研究新算法,新模块出来后可以付费升级。
 
5.1基础整合模块:颜色校准Color correction
在拍照时,将标准色卡护照(ColorChecker Passport)放入KeyBox内一起成像。拍照结束后,利用Pheno-suite软件的“Color correction”功能,可以根据标准色卡对图像进行颜色校准,从而还原被摄物体的真实颜色。
5.2基础整合模块:标签识别Label recognition
Pheno-suite软件可以协助生成由10位数字组成的标签并打印出来。在拍照时,将标签条一起成像。利用Pheno-suite软件的“Label recognition”功能,可以自动将标签条识别并读取出来。客户可以将图片文件与标签关联起来,方便数据管理。
5.3基础整合模块:灰度图转换Gray scale conversion
利用Pheno-suite软件的“Gray scale conversion”功能,可以将彩色图像转换为灰度图,供客户使用。
5.4功能强大的模块:生物量测量Biomass detection
利用Pheno-suite软件的“Biomass detection”功能,可以计算样品的像素大小、样品的长度和宽度(将样品包围起来的方形盒的长度和宽度)、样品性状偏离圆形的程度(deviation from circle)。
 Plant pixel size
 Length/width bounding box
 Deviation from circle
5.5功能强大的模块:形态大小测量Tomato size
利用Pheno-suite软件的“Tomato size”功能,可以计算样品的像素大小、样品的长度和宽度(将样品包围起来的方形盒的长度和宽度)、样品的椭圆度(最大轴长、最小轴长、朝向)。
 Plant pixel size
 Height/width bounding box
 Elipse (same second central moment)
 Major axis length
 Minor axis length
 Orientation
5.6功能强大的模块:种子萌发测量Seed germination in tray
利用Pheno-suite软件的“Seed germination in tray”功能,可以计算样品的总像素大小、样品的平均像素大小、样品像素大小的标准差等。这些可以用于判断种子的萌发率。
 Total pixel size
 Average object pixel size
 STDEV object pixel size
5.7功能强大的模块:叶片大小测量Leaf size detection
利用Pheno-suite软件的“Leaf size detection”功能,可以计算样品数目,以及每个样品的总像素大小、样品的长度和宽度(将样品包围起来的方形盒的长度和宽度)、样品性状偏离圆形的程度等。
 # Objects
 Per Object
 Total pixel size
 Length/width bounding box
 Deviation from circle