人类miRNA芯片Human miRNA OneArray ® v5
人类 miRNA 芯片 v5 延续 v4 的设计原理, 参考 Sanger miRBase 数据库 release 19.0 的序列进行探针设计, 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。v5 版芯片于 2013 年 7月正式上线。
探针信息
人类miRNA芯片v5探针内容 |
学名 | Homo sapiens |
常用中文名称 | 人类 |
探针代表号 | hsa |
常用英文名称 | Human |
miRNA探针数 | 2,003 |
总所对应的成熟miRNA数 | 2,019 |
miRNA探针重复数 | 3 |
控制探针数 | 144 |
总探针数 | 6,153 |
基因探针
人类 miRNA 芯片 v5 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 19.0 的序列进行探针设计, 共有 2,003 个序列,可对应到 2,019 个成熟的 miRNA, 在探针设计的过程,依据各序列的特性,进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上,每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。
控制探针
为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以***完整的芯片实验步骤,包含样本RNA完整性、样本RNA放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。
小鼠&大鼠miRNA芯片 Mouse&Rat miRNA OneArray® v4
小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 延续 v3 的设计原理, 参考 Sanger miRBase 数据库 release 18 的序列进行探针设计, 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。v3 版芯片于 2012 年 3 月正式上线。
探针信息
小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 探针内容 |
学名 | Mus musculus | Rattus norvegicus |
常用中文名称 | 小鼠 | 大鼠 |
常用英文名称 | Mouse | Rat |
探针代表号 | mmu | rno |
miRNA探针数 | 1,129 | 676 |
所对应的成熟miRNA | 1,157 | 680 |
RmiOA v3 miRNA探针总数 | 1,362 |
RmiOA v3 所对应的成熟miRNA总数 | 1,837 |
miRNA探针重复数 | 3 |
控制探针数 | 144 |
总探针数 | 4,230 |
基因探针
小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 18 的序列进行探针设计, 共计 1,362 个序列, 可对应到 1,837 个成熟的 miRNA, 在探针设计的过程,依据各序列的特性,进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上,每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。
控制探针
为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以***完整的芯片实验步骤,包含矩阵校准标记探针、 阳性控制探针及阴性控制探针。
华联生物芯片探针设计主要以Sanger miRBase的资料库为主,依资料库的更新状态,定期提供新版本探针内容的人类、小鼠与大鼠的标准miRNA芯片,详细规格如下表:
miRNA芯片 | 基因探针数 | 对应miRNA数 | 控制探针数 | 探针重复数 | 参考数据库 |
HmiOA v3 Human miRNA OneArray | 1,711 | 1,732 | 105 | 3 | Sanger miRBase v17 |
RmiOA v3 Mouse & Rat miRNA OneArray | Mouse 1,080 | Mouse 1,111 | 105 | 3 | Sanger miRBase v17 |
Rat 680 | Rat 672 |
MPmiOA v3 Model Plant miRNA OneArray | 1,022 | 1,817 | 105 | 3 | Sanger miRBase v17 |