以220多条药物代谢酶和相关转运蛋白基因上的多态性位点为靶点
可以检测SNPs,插入/缺失,多核苷酸多态(MNPs)各种多态位点
全部试剂经过实验验证,保证良好效果,现成试剂盒保证快速得到结果
在不同人群的180个独立DNA样本中进行了验证
和公共等位基因命名数据库上的命名一一对应
简介
超过2000个位点的TaqMan®药物代谢基因分型试剂盒已经诞生,这2000多个位点涵盖了220多个编码药物代谢的酶(DMEs)和相关转运蛋白的基因。这些药物代谢相关基因的多态可能会影响药物代谢的个体差异,从而导致个体的药物疗效和药物副作用的差异。目前,这些药物代谢基因的复杂机制只有很少的研究,因为很少有技术能够系统有效的分析这些基因的多态性。在这套试剂盒中的所有位点都针对药物代谢基因的潜在功能性多态位点,因为只有在调控区,编码区或者剪切区域的多态位点才被选用。
TaqMan®药物代谢基因分型试剂盒通过了高质量的生物信息学分析和严格的预实验验证。这套试剂盒根据多个公共SNP数据库(包括公共等位基因命名网站)设计而成,所有的试剂盒都通过了四个人群的180个独立DNA样本测试。TaqMan®药物代谢基因分型试剂盒可以在ABI公司的任何一套实时荧光定量PCR仪器和TaqMan® SNP分型平台上使用。
药物代谢相关基因
药物代谢相关酶的编码基因是药物开发和临床研究的重要靶基因,他们能影响个体对药物反应的差异,以下是这方面的一些重要基因:
CYP2D6:细胞色素P450系统57个基因中的一个重要成员,它参与了体内20-25%抗节律运动障碍,抗抑郁症,抗精神性疾病,β阻滞剂和镇痛剂等药物的代谢。
NAT1和NAT2(N-乙酰转移酶):这些基因编码的酶代谢很多种致癌物,还有结核杆菌治疗的一线用药-异烟肼。
MDR1(也称作ABCB1基因和P糖蛋白1):MDR1是和药物转运相关的多耐药基因,这些基因参与了代谢物在细胞膜之间的转运过程。
除了表格2上列出的基因以外,完整的相关基因资料可以到dme.appliedbiosystems.com上查询。
筛选和确定多态位点
药物代谢酶编码基因的多态性包含了单核苷酸多态(SNPs),插入/缺失多态和多碱基多态(MNPs)。这些多态信息从三个资源中获得,公共的数据资源如dbSNP,HGMD以及公共等位基因命名网站;和制药工业合作得到的数据资源以及ABI公司自己的SNP数据库。起初,220个基因中所有的SNP都被选出来,然后从中筛选出调控区,编码区和剪切连接区域的SNP。公共等位基因命名网站上的资料为所挑选每个的药物代谢酶多态位点提供了通用名称。通用的等位基因名称可以在dbSNP数据库中免费下载,下载的文件包含了多态和rs号信息。
选择TaqMan®分型技术
我们选择了TaqMan®等位基因分辨技术作为TaqMan®分型试剂盒的方法,因为这种分型技术准确,可靠,重复性好,简便易行。每个试剂盒包含了两条等位基因特异的探针和一对引物来检测SNP位点。引物和探针都在基因组上唯一结合,使得TaqMan®分型技术提供了无与伦比的特异性。正是这种高特异性使这些试剂盒能够对位于高同源性的基因家族或含有假基因的基因SNP进行准确的分型。引物和探针序列都经过BLAST序列比对,确定它们在基因组中结合的唯一性。
这套系统中的所有SNP试剂盒都在相同的荧光定量PCR仪器实验条件下运行,免去了优化条件的步骤。这些试剂盒采用相同的PCR循环参数包括50个循环和一步90秒的延伸步骤,其他所有的实验参数和普通TaqMan®分型试剂盒一致。为了简化和整合实验室操作流程,所有的TaqMan®分型实验可以采用药物代谢TaqMan®试剂盒的热循环参数进行。
良好的验证结果
这套SNP的每个试剂盒起初都用45个美国黑人和45个高加索人的3ngDNA样本进行了重复实验,如果实验结果良好,在另外的45个中国人和45个日本人样本中再次进行重复实验。对所有的实验结果都进行了评估,包括重复性,信号强度和等位型判读的可靠性。
产品的灵活性
这套试剂盒中的每个产品都可以单独定购和使用或者选择一些成套购买。根据你的实验需要可以灵活的选择试剂盒的数量—可以选择单个试剂盒,一个基因的所有试剂盒或者一些基因的组合。顾客可以从位于ABI公司的网站上dme.appliedbiosystems.com的myScience页面来选择和定购这些试剂盒。
DME试剂盒索引
DME试剂盒索引附含在所有DME试剂盒中,索引文件罗列了每个试剂盒和可以获得的它的序列文本,NCBI基因组位置,dbSNP的rs号和公共等位基因命名信息。另外,基因名称(包括基因化名),SNP类型,氨基酸改变和低频等位基因频率等信息也可以从索引上获得。从网址dme.appliedbiosystems.com上可以下载DME试剂盒索引或者从附含在DME分型试剂盒中的光盘上得到。
快速发货,简单包装
所有这些药物代谢酶SNP试剂盒都有库存,可以随时接受订单以确保快速发货。和其他的TaqMan® SNP分型试剂盒一样,这些单管包装的产品包含了两条等位基因特异性的MGB探针(VIC或者6-FAM标记)和两条基因特异性的引物。另外,所有的产品都统一采用小包装,一个20×的单管反应液,能够完成750个5ul体系的反应(见表三)。
强有力的实时荧光定量PCR系统
美国应用生物系统公司的实时荧光定量PCR系统提供强有力的实验方案支持,使得实时定量PCR能够满足任何一个有需要的实验室。这些系统都配备了新一代的软件,使用非常方便,当然它们还有AB公司详尽完整的预实验验证,质量保证和长期的可靠性做支持。
AB公司7900HT快速实时定量PCR系统-最优的表现和灵活性
1、 可更换的模块选择,用户可在96孔板,384孔板,低密度芯片(微流卡)和快速96孔板之间随意更换使用模块。
2、 加长寿命的488nm氩离子激光管和500-660nm连续波长荧光检测系统为仪器提供了出众的染料和荧光解读能力。
3、 自动加样系统带来了无需管理的自动化运行体系和巨大的实验通量。
4、 优秀的企业版本软件能够同时自动分析成百上千块板的试验数据并且符合21CFR part11 compliance的法规要求。
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1、 改进的五色荧光检测支持更大范围的荧光基团检测,多种波长激发光提高了对长波染料检测(红光部分)的敏感性。
2、 相对定量软件能够同时分析10个96孔板基因表达量的数据。
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1、 四色荧光检测系统提供了所有的主要应用。
2、 功能多样,强有力的软件分析系统使得实验数据收集和处理变得简单直接。
3、 精确的光学系统和CCD照相机能够提供准确,可信,重复性高的实验结果。
4、 专利的样品温度控制系统能够提供优越的实验重复性,一致性和高质量的实验结果。
Feature 特点
· 针对220个药物代谢基因调控区和基因编码区的2000多个高价值多态位点
· 试剂盒可以单一选择
· 可以检测多种类型的多态性
· 加强的试剂盒研发流程保证在已有的实时定量PCR仪器平台上使用
· 精细的生物信息学信息为公共数据库中等位基因信息提供准确的多态性信息和基因组定位信息
· 细致的生物信息学解决了基因的同源序列问题,保证检测特异的多态位点
· 包含Applera公司基因组测序计划发现的新的目标SNP多态位点
Benefit 好处
· 可以检测具体药物代谢速率相关的多态性位点,分析用现有方法难于分析的多态性位点
· 可以根据研究项目的需要选择试剂盒,不为固定格式套装试剂锁定—您可以根据项目的进展非常方便的安排后续研究
· TaqMan方法可以在单一平台上检测SNP,基因的插入/缺失和多位点多态性
· 新的药物代谢试剂盒与现有的全部TaqMan试剂盒一体化整合,全部试剂盒可以在同一定量PCR平台上得到理想的结果。(除了50循环/90秒延伸反应外,全部PCR扩增条件一致)
· 节省时间和精力,只需要选择试剂盒,您无需设计自己的试剂盒
· 高度信心: 选择正确的SNP位点保证正确的结果
· 快速得到在其他地方无法得到的内容信息,使您快速找到研究项目重要的SNP位点
联 系 方 式
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