安捷伦Cytogenomics细胞遗传学数据分析软件
英文名称： Agilent Cytogenomics Data Analysis Software
型号:： 最新版本
价格:请致电：010-57128832,18610462672
品牌: 美国    产品商标: agilent / 安捷伦

安捷伦Cytogenomics细胞遗传学数据分析软件

Agilent CytoGenomics software is a complete CGH and CGH+SNP microarray data analysis and data reporting solution. Agilent CytoGenomics provides full support for efficient analysis and data reporting of cytogenetic samples using both information from the CytoGenomics in-house database and external databases such as OMIM, DGV and Entrez. With this new software, Agilent Technologies provides a statistically and visually powerful tool to streamline the day-to-day cytogenetic sample analysis research workflow.

  • Compare data to external databases, including OMIM and DGV
  • Search and compare with your in-house database
  • Automate TIFF image upload, feature extraction and analysis
  • Generate custom reports
  • Perform streamlined analysis of normal constitutional samples in < 5 minutes

PC Version

Minimum

  • 32-bit Windows (XP-SP2 Windows 7 Professional)
  • >2 GHz processor
  • 4 GB RAM
  • 500 GB available disk space
  • 1280 x 768 screen resolution
  • Any program that enables you to open .PDF files (e.g., Adobe®Reader®)
 

Recommended

  • 64-bit Windows (XP-SP2 Windows 7 Professional)
  • >3 GHz processor
  • 8 GB RAM
  • Client machine: 500GB available disc space
    Database machine: 500 GB of dual RAID hard drive
  • 1280 x 768 screen resolution
  • Any program that enables you to open .PDF files (e.g., Adobe®Reader®)

更多信息，请访问 http://www.genomics.agilent.com/CollectionSubpage.aspx?PageType=Product&SubPageType=ProductDetail&PageID=2575
 

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GeneSpring GX为用户提供了多种针对不同数据来源所精心设计，并且适用于常规数据分析任务所需的工作流模式。比如，针对安捷伦公司的芯片数据，GeneSpring GX设计的工作流模式会应用Feature Extraction所包含的质量控制参数来对芯片的数据质量进行评估。除工作流模式之外，GeneSpring GX也为用户提供了数据分析的高级模式。用户可以根据自己的需求，灵活地对各项分析参数进行相应的调整。
 
数据归一化和转换方法
 
在实际操作中，即使用户严格控制实验条件和规范操作，仍然不可能完全避免因为实验不确定因素所导致的数据偏差。GeneSpring GX提供一系列的数据归一化和转换方法，帮助用户有效去除不同实验间的非生物学差异以保证数据的准确性。
 
检验基因差异表达的统计学工具

GeneSpring GX为用户提供了多种功能强大的可以用于检验基因差异表达的统计学工具，包括T检验（T-tests）以及单因素和多因素方差分析（One-way and multi-way ANOVA ANOVA）等。
 
聚类分析和样本类别预测
 
GeneSpring GX为用户提供了多种可以用于在表达谱数据中寻找共性和特征规律的分析工具。样本主成分分析法（PCA）可以将分散在一组变量上的信息集中到某几个主成分上，从而达到数据降维的作用。其它包括K-均值聚类分析（K-means）、系统聚类分析（Hierarchical）以及自组织映射聚类分析（Self-organizing maps）在内的聚类算法，可以基于表达谱数据的相似性，对不同实验组别或是样本数据进行分类研究。GeneSpring GX 10中的样本类别预测工具（Support Vector Machines, Neural Network,Naïve Bayesian和Decision Tree）可以帮助用户快速分析大量的表达谱数据，并且从中找出可能和疾病表型或者其它特征相关的基因标识。
 
 
数据的生物学意义解析
 
对表达谱数据进行分析的目标就是要从那些具有统计学意义的数据结果中找出与其关联的生物学意义。GeneSpring GX不仅可以帮助用户分析单个基因的表达数据，而且提供多种工具来帮助用户从多个视角对实验数据中所提示出的分子代谢通路、分子功能以及可能的表达调控机制进行深度解析。GeneSpring GX提供以下生物学辅助解析工具：
 
  • 最新基因注解更新（支持从NCBI,安捷伦公司和eArray网站在线或是直接通过用户提供的text文档进行更新）
  • Gene Ontology (GO) 富集化分析
  • 基因组分析和基因组富集化分析（Gene and gene set enrichment analysis）
    • 通过GO 浏览器观看基因的主要功能分类
    • 对目的基因进行GO分析
  • 代谢通路分析
    • GeneSpring GX支持Biopax通路交换格式的导入和观看
    • 查找与目的代谢通路相似的其它代谢通路
    • 建立不同分子间的相互作用关系及其它模型
  • Ingenuity Pathway Analysis (IPA)整合工具
 
卓越的数据兼容性
 
GeneSpring GX是开放式的数据分析软件，目前支持包括安捷伦公司，Affymetrix公司，Illumina公司等不同芯片平台所产生的数据。GeneSpring GX 10还可以帮助用户轻松实现跨芯片平台的数据比较和整合。
 
更多信息，请访问
www.genespring.com
 
 

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