人类表达谱芯片 人类表达谱芯片 v6 延续 "One Gene-One Probe" 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。v6 版芯片于 2012 年 9 月正式上市, 根据 RefSeq 51 及 Ensembl 65 数据库进行探针的更新, 以提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。 探针信息 探针种类 | 探针数 | 基因探针设计数据库: - RefSeq release 51 -Ensembl release 65 | 31,741 | 控制探针数 | 938 | 总探针数 | 32,679 | 基因探针 人类表达谱芯片 v6 版本的更新是参考国际公认之 RefSeq 及 Ensembl 序列数据库, 设计长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的人类表达谱基因探针, 内容以 protein-coding gene 为主,相较于 v5 版本, 除了提高整体的基因覆盖率外,更完整的覆盖与生理途径反应相关的基因, 并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。 此外,华联专业团队建构 ”华联探针批注搜索引擎” (PASS) 网站,方便使用者查询各探针相对应于 NCBI 及 Ensembl 数据库的详细批注。 控制探针 为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证,设计一系列的质量控制探针, 以***完整的芯片实验步骤,包含样本 RNA 完整性、样本 RNA 放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。 小鼠表达谱芯片 小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针, 并依据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 数据库进行探针的更新, 提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。 探针信息 探针种类 | 探针数 | 基因探针设计数据库: - RefSeq release 42 -Ensembl release 59 | 26,423 | 控制探针数 | 872 | 总探针数 | 27,295 | 基因探针 小鼠表达谱芯片 v2 版次除了保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针外, 更参考国际公认之 RefSeq 42 及 Ensembl 59 序列数据库, 设计长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主, 提高整体的基因覆盖率外与提供完整的生理途径反应相关的基因, 并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。 控制探针 为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以***完整的芯片实验步骤,包含样本 RNA 完整性、 样本 RNA 放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。 大鼠表达谱芯片 大鼠表达谱芯片为全新开发的表达谱芯片产品,与其它表达谱系列产品一样, 采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理,以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 根据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 数据库进行探针的设计, 提供高基因覆盖率的表达谱芯片,以自主的高速布放技术进行芯片生产。 探针信息 探针种类 | 探针数 | 基因探针设计数据库: - RefSeq release 42 -Ensembl release 59 | 24,358 | 控制探针数 | 980 | 总探针数 | 25,338 | 基因探针 大鼠表达谱芯片是参考国际公认之 RefSeq 及 Ensembl 序列数据库, 设计长炼 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容主要以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主, 提供高基因覆盖率并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。 控制探针 为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以***完整的芯片实验步骤,包含样本 RNA 完整性、 样本 RNA 放大流程、荧光标记效率、芯片杂交、芯片扫描等。 华联目前已有人类、小鼠、大鼠、酵母菌与水稻等表达谱芯片: 表达谱产品 | 总探针数 | 基因探针数 | 控制探针数 | 酵母菌 | 参考数据库 | HOA v5 Huamn OneArray | 30,275 | 29,187 | 1,088 | 60 mer | RefSeq release 38 Ensembl release 56 | MOA v2 Mouse OneArray | 27,294 | 26,423 | 872 | 60 mer | RefSeq release 42 Ensembl release 59 | ROA v1 Rat OneArray | 25,338 | 24,358 | 980 | 60 mer | RefSeq release 42 Ensembl release 59 | YOA v1 Yeast OneArray | 7,642 | 6,958 | 684 | 70 mer | AROSa v1.1 YBOXb v1.0 | RiOA v1 Rice OneArray | 22,063 | 21,179 | 884 | 60 mer | RGAPc v6.1 BGId(2008) | |