5－羟色胺在神经组织中有重要的功能，目前已肯定中枢神经系统有5－羟色胺能神经元。5－羟色胺可使大部分交感神经节前神经元兴奋，而使付交感节前神经元抑制。常用于消化道神经内分泌细胞及其肿瘤的研究。5-羟色胺，又称血清素，由消化道EC细胞所分泌。