离子交换层析（IEC）是各种层析技术中应用最广的一种，它是通过带电的溶质分子与离子交换层析介质上可交换的离子基团通过交换而达到分离纯化的方法，也可认为是蛋白质分子中带电的氨基酸残基与带相反电荷的层析介质的骨架相互作用达到分离纯化的方法。该方法主要依赖电荷间的相互作用，利用带电分子中电荷的微小差异来进行分离。离子交换层析的影响因素众多，其中最为重要的是离子交换介质和缓冲液。
  离子交换层析介质有DEAE（N,N-二乙基氨基乙基）阴离子交换介质、CM（羧甲基）阳离子交换介质、Q（N,N-二乙基氨基-2-羟丙基）阴离子交换介质、SP（磺丙基阳）离子交换介质。此外，还可根据客户需求提供不同配基密度的离子交换介质。