比较基因组分析系统是染色体数目异常的遗传学分析，以及各种肿瘤相关基因扩增或缺失的染色体区域定位的重要研究手段之一。

CGH是直接检测染色体区域扩增或缺失的重要手段。通常病人基因组DNA标记为绿色，正常基因组DNA标记为红色，混合后杂交到正常的染色体标本上，DAPI复染后，通过计算机软件处理，分析染色体的颜色变化，绿色增加的区域示为病人的该染色体区域可能有基因扩增；反之，若红色增加，则提示患者该染色体区域可能有基因缺失。CGH是发现新的癌基因和抑癌基因存在区域的最直接的方法。为进一步深入研究，提供了细胞遗传学依据。

Ø通过高分辨率数字CCD摄象头采集红（TRITC或RHODAMINE）、绿（FITC）、蓝（DAPI）三种颜色的染色体图像；
ØWindows操作系统、图标式功能框，便于操作；