基于成熟的HiSeq 2500系统，凭借创新的图案化流动槽技术，HiSeq 3000/4000系统带来了无可匹敌的速度和性能。双流动槽的HiSeq 4000系统提供了最高的通量和每个样品的最低价格，适合广泛的应用。而单流动槽的HiSeq 3000系统则享有同样的低价格和快速运行时间。

HiSeq3000/4000采用了HiSeq X 系列的Patterned Flowcell，通量提高到每个RUN0.75-1.5Tb，可以开展全基因组、外显子组、转录组等测序，速度是3.5天，2500以前的型号系列还可以销售，但以后会逐渐转向3000\4000系列。

 

HiSeq 3000和HiSeq 4000在可靠的HiSeq 2500的基础上使用了创新的有序流动槽技术，可提供无可比拟的测序速度和性能。HiSeq 4000系统配备2个流动槽，可为多种应用提供最高的测序通量以及最低的测序成本。其配备1个流动槽的HiSeq3000系统具备同样的性能。