Ru Red是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有独特涉及uu小沟区域的具有的荧光染料。在游离状态下，Ru Red发出微弱的荧光，但一旦与双链DNA结合后，荧光大大增强。因此，Ru Red的荧光信号强度与双链DNA的数量相关，可以根据荧光信号检测出PCR体系存在的双链DNA数量。Ru Red与 EB 有相同的光谱特性，无需改变滤光片及观察装置。标准的 EB 滤光片或 SYBR 滤光片都适用，使用与观察 EB 相同的普通紫外凝胶透射仪观察即可，在 300 nm 紫外光附近可得到最佳激发。Ru Red的最大吸收波长约为518 nm，发射波长最大约为605 nm。Ru Red 与双链DNA的亲和力非常高，因此可以用做电泳前染色，对分子生物学中常用的酶（如：Taq 酶、逆转录酶、内切酶、T4连接酶等）没有抑制作用。另外，Ru Red 与EB相比，诱变能力大大降低。