NBD-Cl广泛地用于标记多肽、蛋白质、药物和其它生物分子。它是也HPLC(高效液相色谱)分析中非常流行的衍生试剂。NBD-Cl本身没有荧光，但是一旦与脂肪族胺类或者硫醇化合物反应，产生具有荧光的加合物。它与带胺基基团的分子反应，例如脂肪胺，氨基酸，多肽和蛋白质，形成具有高荧光强度的化合物。NBD-胺加合物在水溶液中，激发光波长ex = 464 nm，发射光em = 512 nm。NBD-胺加合物的荧光光谱属于高度环境敏感型，在水溶液中，其荧光强度显著性降低。NBD-Cl也与硫醇基团反应形成荧光化合物，但是硫醇加合物产生的荧光强度比胺加合物要小。