去除核糖体rRNA，适合lncRNA分析

VAHTSTM Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina®

 

● 包含Ribo-OffTM rRNA depletion module， 可去除人、小鼠、大鼠、牛、狗、马、鸡、猴、猪、斑马鱼等物种的核糖体RNA

● 链特异性建库

● 优化的大片段建库方案

 

图1. Ribo-OffTM模块去除rRNA原理示意图。

 

图2. 使用Ribo-OffTM模块去除rRNA总共耗时不超过2小时，其中操作时间仅需10分钟以内。
 

图3. 1 μg universal human reference RNA分别用Oligo dT磁珠纯化mRNA或者用Ribo-OffTM模块去除rRNA后构建文库，用Hiseq 2500测序。数据与人类基因组数据库hg19进行比对。可以看到， Ribo-OffTM模块可以更有效地去除rRNA，并可保留更多的非编码RNA信息。

 

     VAHTSTM Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina®适用于起始模板为0.1-1 μg的人、小鼠、 大鼠总RNA的链特异性转录组文库构建。与常规mRNA-seq文库构建不同的是，本试剂盒将rRNA (包括细胞质28S, 18S, 5S rRNA以及线粒体12S, 5.8S rRNA)从总RNA中去除，保留mRNA以及其它非编码RNA，可用于lncRNA等非编码RNA的分析。降解的RNA样本也可用本试剂盒进行文库构建。 在第二链cDNA合成时，掺入dUTP标记第二链； PCR前将标记的第二链模板用UDG酶消化，使得最终的测序信息都来自于第一链cDNA，从而保留了RNA的链方向性。测序后的数据分析可确定转录本是来自正义还是反义DNA链。