HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (Low Rox Plus)
英文名称: HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (Low Rox Plus)
型号:null    产品货号: 11202YB03
价格:请致电:010-57128832,18610462672
品牌: 中国/美国
试剂级别: 分子生物学级

 HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (Low Rox Plus)

产品信息

产品名称

产品编号

规格

储存

价格(元)

促销价(元)

HieffTM qPCR SYBR® Green

Master Mix (Low Rox Plus)

11202YB03

1 ml (40rxn(25µl/rxn))

-20

180

 

11202YB08

5×1 ml (200rxn(25µl/rxn))

-20

740

 

 HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (Low Rox Plus)产品描述

HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix(No Rox Plus)浓缩的实时定量PCR扩增的预混合溶液Mix中含有热启动HieffTM DNA PolymeraseSYBR® Green IdNTP MixMg2+Rox 参比染料。使用时,仅需在扩增体系中加入模板和引物即可进行实时荧光定量PCR,大大简化操作过程,缩短操作时间,降低污染几率

本品采用的DNA聚合酶配体可以随温度变化,实时调节DNA聚合酶活性。配方添加了可有效抑制非特异性PCR扩增因子与促进PCR反应扩增效率的因子,使定量PCR可以在宽广的定量区域内获得良好的线性关系。

本产品中预先添加了独特配方的低浓度Rox参比液,用于校正不同孔间的荧光信号误差。

适用机型

本产品中含有用以校正孔与孔之间产生的荧光信号误差的低浓度Rox Reference Dye,适用于以下荧光定量PCR仪:

Applied Biosystems7500, 7500 Fast,ViiATM7, Stratagene MX3000PTM, MX3005PTM, MX4000TM,

QuantStudio™ Dx, QuantStudio™ 6 Flex, QuantStudio™ 7 Flex

其他需要添加低浓度Rox Reference Dye的荧光定量PCR

 HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (Low Rox Plus)运输与保存方式

冰袋运输,-20避光储存,有效期1年。

尽量避免反复冻融,如每次使用量较少,推荐小份分装使用。

 HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (Low Rox Plus)操作流程

【注1】:由于本品检测灵敏度极高,即使空气中微量的DNA气溶胶都可以引起污染,进而导致实验失败。因此反应体系配制时请于超净工作台内进行,配制过程中请使用干净灭菌枪头、反应管,条件容许的实验室推荐使用专用的移液枪,避免交叉污染。推荐使用带滤芯的枪头。

【注2】:由于本品中含有荧光染料SYBR® Green I,因此无论保存还是配置反应体系时都应该尽量避免强光照射。

1使用前务必充分混匀Mix,混匀时避免剧烈震荡以免产生过多气泡。Mix轻微离心后即可使用。

2qPCR反应体系配制*

试剂

体积150 μl

体积220 μl

HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix(Low Rox Plus)

25 μl

10 μl

Forward Primer10 μM

1 μl

0.4 μl

Reverse Primer10 μM

1 μl

0.4 μl

模板DNA

X μl

X μl

无菌蒸馏水

Up to 50 μl

Up to 20 μl

*】:反应体系中各成分的量可根据以下原则自行调整:

a)反应体系中引物浓度一般在0.1-1.0 μM之间,通常引物终浓度为0.2 μM扩增效果较好;

b)扩增产物长度请选择在100 bp-300 bp范围内,尤其推荐100 bp-150 bp之间;

c)模板参照体系:1µg RNA的反转录产物需要稀释10-20倍后再进行使用,以减轻RNAPCR扩增的抑制效应。

d推荐您使用20μl 或者50 μl反应体系,反应体系适合,才足以保证目的基因扩增的有效性和重复性。

3qPCR 反应条件

本产品可以用三步法进行,也可以用两步法程序进行PCR扩增反应。

【三步法程序】

95

5 min

预变性

95

1sec

循环反应(40 cycles

55-60

20 sec

72

20 sec

95

15 sec

熔解曲线

60  

60 sec

95

15 sec

 

【两步法程序】

95

5 min

预变性

95

10 sec

循环反应(40 cycles

60

30 sec

95

15 sec

熔解曲线

60  

60 sec

95

15 sec

 HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (Low Rox Plus)【注】:a预变性时间根据自己模板和引物的情况可适当缩短至1min2min

b:引物退火温度和时间,请根据引物和目的基因的实际情况自行调整。

 c2步法无法扩增的基因,建议采用3步法扩增。

d:熔解曲线采集程序可根据您使用的Real Time PCR仪自行调整,通常情况下使用仪器默认程序即可。

4分析。反应结束后确认Real Time PCR的扩增曲线及解曲线,进行标准曲线制作等。首次实验需要用琼脂糖凝胶电泳确认PCR扩增产物特异

1)对荧光定量而言,Ct落在20-28之间定量最为准确。如果Ct值太小,请稀释模板后重新进行试验;Ct值大于35时,       Real Time PCR检测无效,目标基因无表达;当Ct值介于32-35之间时,需要至少三个重复才能判断目标基因是否表达。


2)如果反应特异性好,无非特异性扩增产物产生,无引物高级结构,则熔解曲线应该是单峰曲线,此时定量结果有效;若解曲线出现显著多峰,则定量结果无效,请优化条件重新进行定量实验。引物设计不合理而导致的引物二聚体同样会影响实验结果的判定

3)使用本品进行绝对定量需自行绘制标准曲线;进行相对定量可根据下述公式计算目标基因表达情况:

设定CtA11号样本目标基因Ct值,CtB11号样本内参基因Ct值;CtA22号样本目标基因Ct值,CtB22号样本内参基因Ct值,则1号样本和2号样本目标基因表达水平比值可粗略计算为(2-△△Ct法):

△△Ct =CtA2-CtB2-CtA1-CtB1= X,则2号样本内目标基因的表达水平为1号样本内的-X 倍。

】:上述计算方法是假定扩增效率为100% (每个循环过后产物量为前一循环产物量乘以2),如实际扩增效率不为100%,需根据实际扩增效率修改计算公式。例如:目标基因和内参基因扩增效率为0.90,则计算公式应该修正为(1+0.90) -△△Ct

引物设计指南

1)扩增产物长度100bp-150bp为佳。重要!

2)引物长度17 bp-25 bp最好。太短的引物容易导致扩增效率降低,太长的引物会导致引物高级结构出现几率增加;

3)引物的3’应尽量避免高GC或高TA含量区域;

4)引物3’端最后一个碱基最好为G或者C,避免使用T

5)正向引物和反向引物的Tm最好相差不要超过1Tm调整至60-65为佳。(引物Tm值推荐使用Primer 5进行计算)。

6)引物的GC含量控制在40%-60%之间,最佳为45%-55%

7)引物AGCT整体分布尽量要均匀,避免使用GC或者TA含量高的区域,尤其是3’,必须避开GC含量不均匀的区域;

8)尽量避开T/C或者A/G的连续结构;

9)避开引物内部或者两条引物之间有3个碱基以上的互补序列,二条引物之间的3’端避开有2个碱基以上的互补序列;

10)引物设计完毕使用NCBI BLAST功能检索核对引物特异性,以避免非特异性扩增产生。

qPCR反应有效性确认标准

1)线性关系以及扩增效率确认:

标准曲线相关系数(R2)>0.98

标准曲线斜率介于 -3-3.5之间

PCR扩增效率(E)介于0.91.2之间

2)重复性确认:

重复管之间的STD0.2

3)特异性确认:

 

扩增产物融解曲线无明显非特异性扩增产物/引物二聚体杂峰(必要时请进行琼脂糖电泳进行确认)