HiScan SQ 整合了基因分型和基因表达芯片的高通量和第二代测序的高分辨力,显著提高实验设计的灵活性。
仪器由两个独立的部分组成:
- HiScan Reader—高效芯片扫描仪
- SQ Module—附加的流体力学设备进行基因组测序
在 HiScan中加装SQ Module,便可轻松将Illumina 强大的第二代测序仪引入实验室系统中。
The speed of microarrays +The power of next-gen sequencing
全基因组分析 | 全基因组基因分型 | 全基因组发现 |
拷贝数变异(CNV) | CNV 分析 | CNV发现 |
目的基因组分析 | 定制和目的SNP基因分型 | 靶区间重测序 |
基因调节与表观遗传分析 | 全基因组DNA甲基化图谱 | • 全基因组DNA 甲基化发现和分析 • 染色体免疫共沉淀测序 (ChIP-Seq) • Small RNA 发现和分析 |
基因表达 | • 全基因组表达分析 • FFPE 样本分析 | 转录组发现和转录组图谱 |
细胞遗传学 | 细胞遗传学异常 | 数字核型分析 |
这些完善的技术为遗传学的发现和确认提供了有利的途径,让研究者可采取任何途径研究基因组、转录组或表观遗传问题。
- 促使目的基因测序成为GWAS研究的延续。
- 基因表达分析可在芯片和测序间转换。
- 确认基于芯片的基因表达和基因剪接变异结果。
- 通过测序实验鉴定目的SNPs,为任何物种和任何研究设计iSelect 定制基因分型芯片
独一无二的模块设计:
从HiScanSQ Reader开始,能够随时加入SQ模块和cBot簇生成系统进行第二代测序。对于想优化芯片样本通量的实验室来说,AutoLoader2.x和liquid handling robots自动样本定位和制备可在限定的时间内达到样本数量的最大化。
Illumina 实验室信息管理系统(LIMS)帮助研究者在芯片分析和测序过程中有效的跟踪样本、减少处理中的错误,方便实施大型方案。
流畅的数据分析:
HiScanSQ的分析软件和硬件形成一个端对端的通路使研究者快速把芯片和测序的大量原始数据转变成可发表的具生物学意义的结果。Illumina的GenomeStudio 数据分析软件对DNA和RNA数据进行简化的图像分析和关联分析。多功能软件包具直观的操作界面,是兼具测序和芯片双系统的分析工具。
灵活的应用:
HiScanSQ支持各种基于芯片和测序的应用。基因分型、基因表达谱和甲基化分析均可在高效能的HiScan Reader上进行。合并短或长末端对读测序,结合2×100 bp读长和边测序边合成原理大大拓宽了测序实验的应用性。两种技术的融合可降低投入,也方便那些样本量有限的实验室使用。
HiScanSQ是第一部集芯片分析和第二代测序于一体的仪器。两种互补技术的组合使其具有了无可比拟的应用广泛性和实验设计的灵活性。方便的模块设计使研究者能够扩建系统丰富研究目的。