安捷伦的ChIP-on-chip是一种功能强大的技术，为下一代微阵列技术的发展提供了坚实的基础。该项技术可对支配遗传表达的转录因子的结合区域进行高分辨率的精确分析。通过纯化染色质免疫共沉淀中的蛋白质－DNA结合物，可以富集DNA并进行标记。通过进行微阵列的杂交反应，可鉴别出蛋白质的结合位置。除了可探明转录因子的结合部位，利用这种技术也可对乙酰化组蛋白、甲基化组蛋白和甲基化DNA进行分析。